Punca kewangan utama Yayasan Felda adalah sumbangan daripada Felda dan Syarikat - syarikat subsidiarinya. Manakala pendapatan dari punca lain termasuklah dividen pulangan pelaburan jangka pendek, kutipan bayaran rawatan serta subsidi rawatan hemodialisis. Sejak mula beroperasi pada tahun 1999, sehingga kini sebahagian besar perbelanjaan yang disalurkan antaranya untuk pendidikan dan lain lain perbelanjaan termasuklah bidang kesihatan, geran penyelidikan dan kebajikan.

Pengurusan kewangan Yayasan Felda diselia oleh Bendahari Yayasan.